กระต่ายป่า หรือ กระต่ายหิน สโมสรฟุตบอลจันทบุรี ได้รับการสนับสนุนจากองค์การบริหารส่วนจังหวัด จันทบุรี และสมาคมจังหวัดจันทบุรี ได้เริ่มต้นส่งนักกีฬาเข้าแข่งขันในระดับคัดเลือกตัวแทนภาคกลาง 1, 2 โปรวินเชียลลีก 2 ดิวิชั่น 2 ณ จังหวัดชลบุรี 18-24 ก.ค. 2546 สโมสรฟุตบอลจังหวัดจันทบุรีชนะเลิศได้เป็นตัวแทนภาคกลาง 1, 2 เข้าไปชิงแชมป์ประเทศไทยโปรวินเชียลลีก 2 ปี 2547 ณ จังหวัดพัทลุง 2-10 ก.พ. 2547 สโมสรฟุตบอลจังหวัดจันทบุรีได้อันดับ 3 ของโปรวินเชียลลีก 2 ดิวิชั่น 2 มีสิทธิ์ได้เล่น Play off กับทีมจังหวัดพัทลุงซึ่งได้อันดับ 4 และทีมจังหวัดอุดรธานี และจังหวัดเชียงใหม่ จากโปรวินเชียลลีก 1 ดิวิชั่น 1 ในรอบ Play off ณ ราชมังคลากีฬาสถาน ระหว่างวันที่ 18-22 พ.ย.2547 สโมสรฟุตบอลจังหวัดจันทบุรีชนะเลิศรอบ Play off ได้เลื่อนขึ้นโปรวินเชียลลีก 1 จนกระทั่งปี 2550 เปลี่ยนชื่อจากโปรวินเชียลลีกมาเป็น ไทยลีก ดิวิชั่น 1 จนถึงปัจจุบัน

ปี 2553 บริษัท แคช ทูเดย์ จันทบุรี เอฟซี จำกัด ได้รับมอบหมายจากทางองค์การบริหารส่วนจังหวัดจันทบุรีและสมาคมกีฬาจังหวัด จันทบุรี ให้เป็นผู้ดำเนินการจัดส่งนักกีฬาเข้าแข่งขันโดยใช้ชื่อ “สโมสร แคช ทูเดย์ จันทบุรี เอฟซี”